Int. J. Syst. Evol. Microbiol.-黑蜂巢蜂蜜中分离出双歧杆菌属新种

双歧杆菌是一种肠道细菌，最初分离自母乳喂养的婴儿粪便中，在人类、温血动物和蜜蜂肠道这一复杂多样的生态系统中起着重要作用。同时，蜜蜂肠道中的双歧杆菌在传粉媒介中也发挥着关键作用。目前，已从蜂蜜肠道中分离出多个双歧杆菌新种。然而，关于蜂巢蜂蜜中双歧杆菌的研究仍然较少。近日，内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室刘文俊研究员在International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology（3区，IF：2.0）上发表最新研究成果。该研究从云南省德宏傣族景颇族自治州梁河县悬崖边的黑蜂巢蜂蜜中分离得到一个双歧杆菌属新种——Bifidobacterium favimelis sp. nov.。

要点

1.基于16S rRNA基因序列相似性分析表明，菌株IMAU50987与Bifidobacterium mellis Bin7N的亲缘关系最近，序列相似性为98.5%，低于新物种划分的阈值；

2.基于88个核心基因的系统发育进化树分析表明，菌株IMAU50987属于B. asteroides类群，与其它双歧杆菌属模式菌株不同；

3.菌株IMAU50987与Bifidobacterium choladohabitans B14384H11和Bifidobacterium apis F753-1的ANI值最高，均为77.0%；与Bifidobacterium  apis F753-1和Bifidobacterium xylocopae XV2的dDDH值最高，均为23.1%；与Bifidobacterium polysaccharolyticum W8117的AAI值最高，为73.2%。这些值均低于新物种划分的阈值；

4.菌株IMAU50987是革兰氏染色阳性、不运动、不产生孢子的杆状细胞（0.4-0.6×0.8-1.4 µm），通常单个或成对出现。在35℃严格厌氧条件下培养72 h后，mMRS琼脂上菌落呈圆形、半透明、凸状，直径约1.0 mm。在mMRS培养液中，细胞可在20-42℃（最适35℃）和pH 5-9（最适pH 6）下生长。F6PPK阳性；

5.菌株IMAU50987的主要细胞脂肪酸为C16:0和C18:1ω9c和Sum in Feature 7（C19:1ω7c/C19:1ω6c）；主要极性脂是二磷脂酰甘油（DPG）、磷脂酰乙醇胺（PE）、磷脂（PL）、磷脂酰甘油（PG）、三种未识别的磷酸糖脂（PGL）和五种未识别的糖脂（GL）；细胞壁肽聚糖类型是A3α L-Lys-Gly；

6.菌株IMAU50987基因组草图的DNA G+C含量为63.5%。16S rRNA基因序列登录号为PP390173。全基因组登录号为JBANDZ000000000。

目前，关于蜂巢蜂蜜中双歧杆菌的研究较少，大多都集中在蜜蜂的胃肠道当中。本研究基于分子分类学方法，包括16S rRNA测序、全基因组测序和表型分析，对分离自蜂巢蜂蜜中的双歧杆菌菌株IMAU50987的分类学地位进行了表征。证明菌株IMAU50987属于双歧杆菌属B. asteroides类群的一株新种，也进一步表明双歧杆菌在传粉媒介中发挥着重要作用，为探究不同生境双歧杆菌的生物多样性、生态系统以及进化生物学研究等提供了科学价值。