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内蒙农大张和平教授团队Nature子刊发表重要成果

时间:2023-05-08 来源:实验室 作者:张猛 浏览次数:14828

腺嘌呤甲基化在副干酪乳酪杆菌生理学中的作用

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DNA甲基化是细菌一种常见的表观遗传机制,通过将甲基转移到胞嘧啶和腺嘌呤的特定位置形成5-甲基胞嘧啶、4-甲基胞嘧啶或6-甲基腺嘌呤(6mA)。作为一种不同于基因序列的遗传修饰方式DNA甲基化与许多生物学特性密切相关,包括染色体复制、基因组稳定、纠正DNA错配以及细胞周期偶联转录等。其中,6mA是最普遍的一种甲基化方式,在调节基因表达和形成致病菌的宿主细胞方面起作用。6mA也是食品工业用菌和益生菌重要来源——副干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei的重要表观遗传修饰方式,但其在副干酪乳酪杆菌中的生理功能却鲜为人知。

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副干酪乳酪杆菌的种内基因组相似性、核心基因组和泛基因组

202356日,内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室张和平教授团队在国际期刊Nature CommunicationsQ1IF=17.694)发表重要研究性论文。


该成果以副干酪乳酪杆菌为研究对象,利用多组学和高通量染色体构象捕获(Hi-C)进行了深入分析,研究了6mA甲基化修饰在副干酪乳酪杆菌中的作用。研究发现6mA甲基化修饰位点的分布在28个菌株的基因组中各不相同。在群体水平,副干酪乳酪杆菌甲基化位点的分布偏向于碳水化合物代谢基因甲基化基因pglX缺失突变株在6mA修饰方面有缺陷,显示出转录组的改变,但在生长和基因组空间组织结构方面只有微小的变化。本研究揭示了6mA甲基化在副干酪乳酪杆菌中的生理作用,为食品发酵工艺的优化提供了重要的理论基础。

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副干酪乳酪杆菌分离株中甲基化位点的基序偏向性分析和分布情况
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差异表达基因(DEGs)和差异表达蛋白质(DEPs)功能分类和代谢通路富集分析

论文作者:赵洁、张猛、惠文彦、张悦、王静、王绍靖、郭丽茹、孔健、张和平、张文羿


论文题目:Roles of adenine methylation in the physiology of Lacticaseibacillus paracasei


原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-023-38291-1



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