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Nature:反向代谢组学方法,挖掘IBD新线索

时间:2023-12-08 来源:热心肠日报 作者:九卿臣 浏览次数:1105

Nature[IF:64.8]

① 开发反向代谢组学方法,通过合成新化合物→获得质谱图(LC-MS/MS)→搜索公共代谢组数据(MASST)→元数据分析(ReDU),揭示代谢物与表型、物种、样本类型的关联;

② 对4类人体代谢物进行合成和探索,其中胆汁酸类分子的分析表明,克罗恩病中Glu、Ile/Leu、Phe、Thr、Trp和Tyr结合型胆酸升高,并在4个IBD队列中验证;

③ 双歧杆菌属、梭菌属和肠球菌属等可产生某些胆汁酰胺化合物,可能通过调节T细胞的IFNγ生成和激动PXR促进肠道炎症。

Reverse metabolomics for the discovery of chemical structures from humans
12-05, doi: 10.1038/s41586-023-06906-8

【主编评语】近年来,微生物组研究开始将重点从微生物本身转向它们产生的分子。这些分子会直接与人体细胞互作,影响宿主健康。然而,试图确定人体微生物组正在产生哪些分子是相当具有挑战性的。近日,加州大学圣地亚哥分校研究人员在Nature发表最新研究,通过结合有机合成、数据科学和质谱分析等开发出反向代谢组学新方法,发现了数百种以前从未在人体中观察到的分子,还可以较好鉴定出炎症性肠病(IBD)的生物标志物,值得关注。


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