黄世万/黄秀娟/张琳Cell子刊:儿童肠道微生物组研究重磅新资源——MAGIC数据库揭示早期生命中的细菌与病毒动态
时间:2024-11-27 来源: 热心肠研究院 作者:热心肠小伙伴们 浏览次数:978Cell Host and Microbe[IF:20.6]
① 香港中文大学黄世万、黄秀娟、张琳团队发表研究,建立了一个儿童宏基因组组装基因组数据库MAGIC,不仅能够表征早期微生物组动态,还能识别基石物种,并对目标物种进行菌株水平研究;
② MAGIC包含了3299个原核生物和139624个病毒的物种水平基因组,其中8.5%的原核生物和63.9%的病毒是MAGIC独有的;
③ MAGIC改善了生命早期微生物组的分析,尤其对非洲儿童样本分析的提升最大;
④ 研究识别出54个候选基石物种,包括几种双歧杆菌和四种噬菌体,它们组成的功能群的丰度随时间波动,并与早产和儿童过敏相关;
⑤ 通过分析长双歧杆菌的泛基因组,发现了噬菌体介导的进化以及与群体感应相关的生态适应的证据。
A metagenome-assembled genome inventory for children reveals early-life gut bacteriome and virome dynamics
11-25 , doi: 10.1016/j.chom.2024.10.017
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