国内团队Cell：解析3500年前的奶制品，揭示人类与乳酸菌的演化互动

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① 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所付巧妹、中国科学院大学杨益民与团队发表首个古代奶制品遗存宏基因组研究，该研究通过分析新疆小河墓地出土的距今约3500年的青铜时代的开菲尔奶制品残留DNA，揭示了当地人群过去的文化交流、发酵技术的传播以及微生物的驯化；

② 从发酵乳制品中提取的山羊DNA暗示了小河人群与欧亚草原人群之间存在交流；

③ 系统发育关系分析显示，古代开菲尔乳酸菌存在欧洲和东亚两个重要分支，古代新疆开菲尔乳酸菌位于东亚分支基部，表明开菲尔乳酸菌及其发酵技术存在一条从新疆向东亚内陆传播的新路线，补充了此前仅有的自北高加索向欧洲传播的路线；

④ 功能基因分析揭示了开菲尔乳酸菌在人类选择和环境压力下的的适应性演化，包括获得抵抗环境压力、增强自身防御、减轻人类肠道炎症反应相关的基因簇；

⑤ 这些发现为了解古代人类文化和微生物进化提供了新视角。

Bronze Age cheese reveals human-Lactobacillus interactions over evolutionary history
09-25 , doi: 10.1016/j.cell.2024.08.008