香港大学：乳酸菌的系统性生物合成研究

Microbiome[IF:16.837]

① 从31977个乳酸菌（LAB）基因组中鉴定出130051个次级代谢物生物合成基因簇 （BGCs），其中大多为物种特异性或菌株特异性或尚未表征，并编码了多种未定性的次生代谢物（SMs）；

② 分析748个HMP宏基因组数据，发现LAB BGCs在人类微生物组中具有高度多样性和生态位特异性；

③ 机器学习预测129878个LAB BGCs可编码不同的生物活性SMs，其中大多可能编码拮抗性细菌素；

④ II类细菌素是最丰富和多样化的LAB SMs之一，在阴道菌群中丰富且占主导地位。

A systematically biosynthetic investigation of lactic acid bacteria reveals diverse antagonistic bacteriocins that potentially shape the human microbiome
04-27, doi: 10.1186/s40168-023-01540-y

【主编评语】香港大学李泳新团队发表在Microbiome上的文章。乳酸菌（LAB）产生各种次级代谢物，从而赋予LAB的机体保护活性，但是LAB衍生的这些次级代谢物的生物合成、尤其是其多样性、丰富度、在菌群中的分布以及对于菌群稳态的相互作用尚不可知。本文系统性研究了LAB生物合成潜力以及在人体菌群的分布，进而通过组学技术将其与菌群稳态的拮抗作用关联，以试图揭示LAB保护机体健康的机理。