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刘洋彧等Nature子刊:利用MAGs剖析人类肠道菌群在新冠中的作用

时间:2022-09-09 来源:热心肠日报 作者:热心肠的小伙伴们 浏览次数:419

Nature Communications[IF:17.694]

① 纳入6个独立队列514个新冠肺炎相关的鼻咽和粪便样本,恢复11584个宏基因组组装基因组(MAG),去冗余获得5403个MAG,代表872个种;

② 新冠肺炎患者肠道菌群中许多物种的菌株丰富度显著降低;

③ 利用非冗余MAG可准确区分新冠肺炎病例和健康个体,并预测新冠肺炎的进展;

④ 新冠肺炎中促发性MAG(Enterocloster bolteae等)与保护性MAG(Blautia_A obeum等)的功能通路不同;

⑤ 促发性MAG的戊糖磷酸途径更完整,这些结果在3个独立队列中可验证。

Dissecting the role of the human microbiome in COVID-19 via metagenome-assembled genomes
09-06, doi: 10.1038/s41467-022-32991-w

【主编评语】新冠病毒已席卷全球,目前还缺乏有效的防治措施,患者常伴有胃肠道症状。近日,哈佛大学医学院刘洋彧及团队发表在Nature Communications的最新研究,纳入六个独立队列共514个新冠肺炎相关的鼻咽和粪便样本,通过重建宏基因组组装基因组(MAGs)探究人类肠道菌群在新冠中的作用,获得了11584个MAGs。发现新冠患者多种物种的菌株丰富度显著降低,相关代谢途径和健康个体也不同,值得关注。(@九卿臣)


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