分离于自然发酵乳制品中的乳杆菌新亚种

　　自然发酵乳制品历史悠久，其中蕴含着种类丰富的乳酸菌资源。近日，内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室从自然发酵乳制品中发现了芫菁迟缓乳杆菌（Lentilactobacillus rapi）的一个新亚种—Lentilactobacillus rapi subsp. dabitei subsp. nov.。该研究于2022年5月6日在国际微生物系统分类学权威杂志《International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology》上正式发表。
 
　　实验室从中国甘肃省夏河县自然发酵酸牦牛奶和俄罗斯布里亚特共和国阿金斯克自然发酵酸牛奶中分离获得两株通过常规鉴定方法不能鉴定到种的乳酸菌疑似新种。通过生理生化、分子生物学和比较基因组学等多项分类学方法对菌株IMAU80584^T和IMAU92037的确切分类地位进行鉴定。多项分类学研究主要包括16S rRNA基因序列分析，pheS和rpoA基因序列分析，全基因组序列分析，DNA G+C mol%测定，平均核苷酸一致性分析（ANI），DNA-DNA杂交分析，脂肪酸甲酯（FAME）分析，极性脂分析和表型特征分析。

　　结果表明，菌株IMAU80584^T和IMAU92037是L. rapi的一个新亚种。该L. rapi新亚种以其首先发现单位—内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室的英文名称（Dairy Biotechnology and Engineering）首字母（dabte）和字母“i”构成新的种加词，命名为：Lentilactobacillus rapi subsp. dabitei subsp. nov.，指定模式菌株是IMAU80584^T（=GDMCC 1.2566^T=JCM 34647^T），保藏于广东省微生物菌种保藏中心和日本微生物菌种保藏中心供研究者无偿获取。菌株IMAU80584^T和IMAU92037是杆状（0.7-0.8 µm×1.7-1.9 µm）、无运动性、无芽孢、无鞭毛、革兰氏染色阳性、过氧化氢酶阴性的兼性厌氧细菌。在MRS琼脂培养基上厌氧培养48 h的菌落呈米色、圆形、扁平、边缘略粗糙的形态，直径约1-2 mm。在MRS肉汤培养基中，菌株在pH值4.5-8.5，温度10-45℃下可以生长，最佳生长温度为37℃。可以在浓度为0-8%的NaCl（w/v）中生长，最佳NaCl生长浓度范围是0-5%（w/v）。

　　菌株IMAU80584^T和L. rapi DSM 19907^T之间的ANI值和DNA-DNA杂交值分别为93.1%和52.8%。新的亚种菌株IMAU80584^T和IMAU92037拥有独特的极性脂L1-3和脂肪酸C_11:0和C_18:1ω9t；不能发酵葡萄糖酸钾；没有泛醌和甲基萘醌；DNA G+C mol%含量分别为42.35 mol%和42.28 mol%。

图1 新亚种及其近缘模式菌株的核心基因系统进化树

图2 菌株IMAU80584^T在MRS琼脂上37℃培养48 h的菌落图像（A）和透射电镜图（B）
 

第一作者：硕士研究生李瑜、博士研究生李伟程、硕士研究生罗瑞；通讯作者：刘文俊研究员。


原文链接：https://doi.org/10.1099/ijsem.0.005359