北大团队：单细胞测序系统评估大肠癌类器官培养体系

Genome Biology

① 纳入7名结直肠癌患者体内肿瘤组织和癌旁正常组织，对其体外培养建立类器官并进行了单细胞转录组测序；

② 肿瘤类器官能准确反映对应体内癌细胞在基因表达、基因突变及DNA甲基化等方面的关键特征；

③ 正常肠上皮类器官在转录组水平上表现出部分肿瘤样特征，但在培养体系中保持了正常的基因组和DNA甲基化组特征；

④ 两种培养体系对于维持体内肿瘤细胞的关键特征均有效，但条件培养基在肿瘤类器官长期培养方面优于化学成分确定的培养基。

Systematic evaluation of colorectal cancer organoid system by single-cell RNA-Seq analysis
04-28, doi: 10.1186/s13059-022-02673-3

【主编评语】结直肠癌是全球最常见的癌症之一，如今，研究人员利用患者的肿瘤组织构建类器官体系已成为研究肿瘤发生分子机制的常用手段。近日，北京大学汤富酬与北京大学第三医院付卫及团队在Genome Biology发表最新研究，采集7名结直肠癌患者体内肿瘤组织和癌旁正常组织，通过体外培养构建了对应的类器官模型。基于转录组、基因组和DNA甲基化组发现两种现有的培养体系中的肿瘤类器官可以较好维持患者体内癌细胞的关键生物学特征，且条件培养基在肿瘤类器官长期培养方面优于化学成分确定的培养基。总之，该研究为系统评估结直肠癌类器官培养系统，解析类器官与体内癌细胞间异同提供了新见解。