Prosci-Lab 新成果 Food Res. Int. |鼠李糖乳酪杆菌的生态位驱动和种内功能多样化研究

鼠李糖乳酪杆菌是革兰氏阳性菌，广泛存在于各种生态位中，包括乳制品、胃肠道和哺乳动物的生殖道等。鼠李糖乳酪杆菌因其独特的益生特性及广泛的自然栖息地（特别是它们与乳制品和宿主肠道的关联）长期受到科学界和工业界的关注。近日，内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室在Food Research International（Q1，IF: 8.1）发表了有关鼠李糖乳酪杆菌的最新研究。该研究对384个鼠李糖乳酪杆菌基因组进行比较基因组学分析（257个肠道分离株和127个乳源分离株，其中93株分离自同一奶酪样品）。结果发现鼠李糖乳酪杆菌具有一个大而开放的泛基因组。系统发育树分析发现乳和肠道来源的分离株/基因组在树上随机分布，而肠道来源的菌株含有更多编码特定代谢途径和碳水化合物活性酶的基因。此外，干酪源鼠李糖乳酪杆菌分离株存在明显的种内多样性且不同分支代谢功能存在显著差异。这些结果暗示了鼠李糖乳酪杆菌在单一食物基质中的基因组/功能多样化，以及分离自乳制品和肠道生态位菌株的适应性进化。

内容要点

2. 系统发育树中乳制品和肠道来源分离株随机分布，鼠李糖乳酪杆菌在不同生态位中表现出基因组/功能多样化；

3. 来自同一奶酪样本的鼠李糖乳酪杆菌的三个进化分支中观察到超过10,000个SNP；

4. 来自同一奶酪样本的鼠李糖乳酪杆菌分离株在每个分支中都具有独特的代谢途径。

小菌君读后感

研究发现来自同一样本的乳酸菌菌株存在种内异质性，基于菌株遗传和特征的分析将有助于选取具有与工业应用相关的特定特征的潜在菌株。

第一作者：Lijun You; Ruirui Lv

原文链接：DOI: 10.1016/j.foodres.2023.113446