马骁驰+果德安+王超Cell：迄今最大的人类肠道真菌参考基因组目录

Cell[IF:64.5]

① 大连医科大学马骁驰、法国国家农业研究院Francis Martin、中国科学院上海药物研究所果德安、大连医科大学王超作为共同通讯作者在Cell发表重要研究，通过大规模人类肠道真菌培养测序，建立了培养肠道真菌（CGF）参考基因组目录，揭示了人类肠道真菌多样性及其在常见疾病中的潜在作用，显著扩展了现有肠道真菌基因组资源，为肠道真菌组研究提供了重要参考数据；

② 从135名健康中国人粪便样本中培养出12453株真菌，并进行全基因组测序，获得760个肠道真菌基因组，涵盖48个科、206个种，其中69个种为首次鉴定，CGF目录使肠道真菌的物种和蛋白质家族的基因组资源分别增加了4倍和2倍多；

③ 对CGF基因组进行功能分析以及靶向代谢组学分析，描述了肠道真菌在基因功能、代谢产物方面的情况；

④ 将CGF目录与公开的人类相关真菌（PHF）基因组资源结合起来，分析1.1万个人类粪便宏基因组数据，揭示了中国和非中国人群的肠道真菌组结构特征；

⑤ 分析28个疾病的肠道真菌组特征，鉴定出疾病共享和疾病特异性的肠道真菌特征，或可作为疾病标志物，并在小鼠结肠炎模型中验证了部分特征性真菌信号的生物学效应，以及潜在的保护机制与物质基础。

A genomic compendium of cultivated human gut fungi characterizes the gut mycobiome and its relevance to common diseases
05-21 , doi: 10.1016/j.cell.2024.04.043