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马骁驰+果德安+王超Cell:迄今最大的人类肠道真菌参考基因组目录

时间:2024-05-22 来源:热心肠研究院 作者:热心肠小伙伴们 浏览次数:1039

Cell[IF:64.5]

① 大连医科大学马骁驰、法国国家农业研究院Francis Martin、中国科学院上海药物研究所果德安、大连医科大学王超作为共同通讯作者在Cell发表重要研究,通过大规模人类肠道真菌培养测序,建立了培养肠道真菌(CGF)参考基因组目录,揭示了人类肠道真菌多样性及其在常见疾病中的潜在作用,显著扩展了现有肠道真菌基因组资源,为肠道真菌组研究提供了重要参考数据;

② 从135名健康中国人粪便样本中培养出12453株真菌,并进行全基因组测序,获得760个肠道真菌基因组,涵盖48个科、206个种,其中69个种为首次鉴定,CGF目录使肠道真菌的物种和蛋白质家族的基因组资源分别增加了4倍和2倍多;

③ 对CGF基因组进行功能分析以及靶向代谢组学分析,描述了肠道真菌在基因功能、代谢产物方面的情况;

④ 将CGF目录与公开的人类相关真菌(PHF)基因组资源结合起来,分析1.1万个人类粪便宏基因组数据,揭示了中国和非中国人群的肠道真菌组结构特征;

⑤ 分析28个疾病的肠道真菌组特征,鉴定出疾病共享和疾病特异性的肠道真菌特征,或可作为疾病标志物,并在小鼠结肠炎模型中验证了部分特征性真菌信号的生物学效应,以及潜在的保护机制与物质基础。

A genomic compendium of cultivated human gut fungi characterizes the gut mycobiome and its relevance to common diseases
05-21 , doi: 10.1016/j.cell.2024.04.043

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