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采用菌株水平多组学技术解析中国和与欧洲奶酪的菌群、风味差异

时间:2021-06-30 17:02来源:未知 作者:bio149发布 浏览次数:
内蒙农大孙志宏:采用菌株水平多组学技术解析中国和与欧洲奶酪的菌群、风味差异

  采用菌株水平的多组学分析揭示了不同地区奶酪的显著差异

  导  读

  2021年6月29日,内蒙古农业大学:Yang Chengcong(1作),You Lijun(共1),孙志宏*(通讯)等在LWT-Food Science and Technology(IF:4.006)发表题为“Strain-level multiomics analysis reveals significant variation in cheeses from different regions”的研究文章。

  该研究认为中国和欧洲的奶酪具有不同的感官品质,奶酪的风味品质与其细菌微生物组、噬菌体组成和代谢组有关。因此,作者从中国和欧洲共收集了八个奶酪样品。采用深度宏基因组测序和液相色谱-质谱法(LC-MS)描述与这些样品相关的菌株级分类和功能微生物组的特征。这项研究进一步确定了奶酪相关微生物的具体特征,包括碳水化合物活性酶(CAZymes)、次级代谢物簇和成簇的规则间隔短回文重复序列 (CRISPR),用于重建噬菌体感染历史及其对发酵的影响。

  该研究使用深度宏基因组测序和液相色谱-质谱法分析了四种中国奶酪和四种欧洲奶酪的微生物组和代谢组。研究结果揭示了样品之间奶酪微生物组和代谢组的巨大差异,但来自同一地区的样品具有更高的相似性。

  深度宏基因组测序确定了四种新物种(Salinicoccus, Kocuria, and Glutamicibacter genera属),它们的碳水化合物活性酶和次级代谢物簇编码基因的特征促进这些新物种参与奶酪风味的形成。中国和欧洲奶酪之间的主要差异代谢物是氨基酸和挥发性物质。在单个奶酪相关细菌分类群(尤其是乳酸菌)和代谢物(r>0.6,p<0.05)之间发现了显著的相关性,表明这些分类群和代谢物共同塑造了奶酪风味。

  奶酪微生物组包含很高比例的噬菌体 (26.06%),从而提供了噬菌体感染/基因组整合和从噬菌体到细菌的水平基因转移的证据。这种过程还将调节奶酪微生物组,从而调节风味品质。


 
  孙志宏

  孙志宏,内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室研究员,博士研究生导师,国家优秀青年科学基金获得者。

  从事乳酸菌生物多样性、基因组学和肠道微生物等方面的基础研究,主持承担国家自然科学基金项目、863项目、内蒙古自治区自然科学基金项目,入选内蒙古自治区“草原英才”工程、内蒙古自治区“321人才工程”。发表学术论文128 篇,其中第一作者和通讯作者学术论文55 篇;授权发明专利12 项,参编学术专著2 部,参与起草5 项质量安全地方标准。获教育部技术发明一等奖,内蒙古自治区科学技术进步一等奖、教育部科学技术进步二等奖、内蒙古自治区自然科学二等奖等科技奖励,荣获内蒙古青年创新人才奖、内蒙古优秀科技工作者称号、内蒙古自治区优秀博士学位。

  原文链接:https://doi.org/10.1016/j.lwt.2021.112043

 


 
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